前言

您可能对 scRNA-seq 解析感兴趣，但不确定从何入手……也有可能将解析工作委托给外部机构……。scRNA-seq 解析是一项革新性的技术，用于在单个细胞层面上分析基因表达。该技术需要高度的生物信息学知识。本书将通过 R 语言和 Seurat 库，教您如何解析公共数据库中注册的 scRNA-seq 数据。

基于零散的网络文章学习 scRNA-seq 解析是极其困难的。我有多年的实验室研究经验，深知在繁忙的湿实验过程中学习编程的困难。因此，我认为有必要通过技术书籍的形式，系统地总结出 scRNA-seq 解析的高效学习方法。如果能将公共数据的 scRNA-seq 解析应用到自己的研究中，再结合湿实验，您的论文质量将会显著提升。

本书特别适合以下读者：

对单细胞 RNA-seq 感兴趣但不知道从何开始的人
将单细胞 RNA-seq 数据解析委托给专业外部机构的人
忙于一般湿实验，没有时间学习编程或统计学的人
想将单细胞 RNA-seq 应用到自己研究中的研究者
在职研究员希望撰写论文，或希望在研究生阶段增加业绩的学生

即使没有编程或统计知识也没有问题。本书是为那些没有编程经验的读者精心设计的，从 PC 设置、R 语言的使用、Seurat 的安装方法开始，详细讲解。

通过本书，您将能够迈出将 scRNA-seq 解析应用于研究的第一步。此外，您还将获得使用 ggplot2 库创建新的图表，以便在论文中展示解析结果的知识。

此外，本书还可作为在职研究员在家用 PC 进行解析的指南。通过这些解析结果撰写论文，争取获得博士学位或攻读在职博士学位，对您也是极大的帮助。

希望本书能够帮助您将对 scRNA-seq 的憧憬和兴趣转化为具体行动，成为您掌握这一领域解析技能的入门指南。

【通知】 2023/05/11：🎉Zenn 本书在 Trending 榜单中获得第二名!! 由于大受欢迎，本书在发布仅 10 天后销量突破 100 册🎉 2023/08/27：销量突破 200 册🎉 2023/10/01：销量突破 300 册🎉 2023/05/19：销量突破 500 册🎉

📰最新更新信息 2023/05/10：技术书首次发布。 2023/05/17：补充了第 5 章内容。 2023/06/14：新增章节：单细胞 RNA-seq 数据的质量控制方法。 2023/08/27：修订了第 1 章和第 2 章。 2023/09/01：新增章节：使用 Cell Ranger 对 scRNA-seq 数据进行基因表达量计数的方法。 2023/09/10：大幅修改和补充第 7 章。 2023/09/16：大幅修改和补充第 5 章。 2023/09/21：再次大幅修改和补充第 5 章。 2023/10/11：全面调整书籍结构。 2023/10/11：扩大了免费公开范围。 2023/10/15：大幅补充第 3 章。 2024/01/28：新增本书专用的 Docker 镜像。

本书中的具体解析例子包括：

UMAP（统一流形近似与投影）