1.5 有关 Bioconductor

关于 R 包管理器 Bioconductor

Bioconductor 是一个用于生物化学数据分析的 R 语言包集合。它管理着数百种包，可以通过 Bioconductor 进行安装。R 语言在生物领域被广泛使用的原因之一就是其丰富的库。我们需要牢牢掌握这一点。

加载包

可以使用 library 函数来加载包。

library(package_name)

安装包

大多数包在使用前需要先安装。可以使用 CRAN 的 install.packages() 函数来安装包。

install.packages("package_name")

安装 Bioconductor 包

对于只在 Bioconductor 上发布的包，需要使用 BiocManager 包的 install 函数进行安装。具体步骤如下：

1. 安装 BiocManager：

   install.packages("BiocManager")
   

2. 加载 BiocManager：

   library(BiocManager)
   

3. 使用 BiocManager 安装 Bioconductor 包：

   BiocManager::install("edgeR")
   

通过上述步骤，您可以安装并使用 Bioconductor 提供的包，以便在生物数据分析中利用这些强大的工具。